使用样品马达台沿样本的边沿移动并聚焦，可以定义出感爱好的样本区域。将配置结果保存为样品配置文件以供今后使用。自动分析结果将存进分析清单，包括了所有必须的参数，如放大倍数、电子区域大小、扫描速度、检测阈值、粒子数目、分类规则文件等。自动特征分析（AFATM）功能启动后，检测到的粒子将根据形态特征和化学成分信息进行分类。
眼镜片分析仪则从AFA中接受检测到的粒子信息。假如AFATM应用程序已完成或停止，利用GSRTM软件可以检验已找到的粒子。
眼镜片分析仪样品收集和制备：
样品的采集过程如下：选择标有“右手”的采样柱，往掉保护盖，除拿柱的手外，不要碰任何东西。从嫌疑人手上收集射击残余物时，将采样柱露出胶黏剂的一面稳稳地压在右手背上，直
至其失往黏性。不要让采样柱在皮肤上滑动或旋转，集中在拇指和食指交汇处的纹状区域。当粘合剂表面用过以后，采用完成，将采样柱重新封装在容器中。使用“左手”采样柱，重复上述过程。假如设备包含手掌采样器，则使 用相同的程序对手掌进行取样。采样完成后，可以使用ASPEX的可变压力设置进行分析，可变压力（低真空）功能可使样品无需用碳或黄金等导电金属涂层。
眼镜片分析仪符合ASTME1588标准：
作为GSR软件的一部分，GSRTM报告模板符合ASTME1588标准，报告包括探测到的粒子机器分类的完整清单，此外缩略图、光谱和粒子数据等也会显示在报告里。报告zui后一部分将显示整版的高分辨率图像和光谱。更多的参数和质量控制信息可以由用户自主设置。
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